营业执照公司类型为有限责任公司（自然人独资），税务登记证为私营独资企业，是交企业所得税还是交个税？

应该没问题，交个税。现在这种问题确实存在，工商、税务的系统数据标准、口径不统一，略有矛盾，叫法很多，让人犯迷糊。你要是不放心，你就问一下税务的，他会告诉你应该如何交税。