一个总电表分成了两个分电表,能不能分开交费

可以，但要协商解决两个分电表和总电表误差的解决方法，由于分电表在这种情况下是总电表的负载，因此分电表的用电数之和会少于总电表的用电数，因此你们要协商合理摊派这一误差（每月一个电表约1度左右）。